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从影响厌氧处理的因素进行分析，可能引起厌氧失效的原因有：
（1）废水负荷即有机物浓度变化太大或水量负荷变化太大。
（2）有毒害物质进入系统，包括高浓度无机物，重金属离子，难降解有机物。
（3）废水温度变化过大。
（4）厌氧池进水含有游离的溶解氧。
（5）废水pH波动太大。
通过对大量污水处理数据的分析，污水处理装置自运行以来出现厌氧失效的主要原因有：浓度冲击。由于污水原水浓度时高时低，低时为600mg/L，高时达90000mg/L，特别是浓度突然增大时，厌氧池有机负荷突然增加，有机酸迅速积累，抑制产甲烷菌的生长，造成厌氧系统的失效。
进水流量的增减会产生水力冲击，也可能造成厌氧池有机负荷的大幅度变化，从而造成厌氧系统的失效。例如流量从几乎为零增至20m3/h时，对厌氧池就造成较大的水力冲击。
毒害物质进入系统时，会抑制厌氧池甚至整个污水处理系统中微生物的生长，使微生物活性降低，甚至中毒失效，造成厌氧系统甚至整个污水处理系统的失效。